南开大学经济实验教学中心被评为天津市教育系统“工人先锋号”先进集体。2007年南开大学经济实验教学中心被评为“天津市普通高等学校优秀教学实验室”，2008年中心被评为“国家级实验教学示范中心”。此外，中心还于2008年获得南开大学的三个集体奖：中心承担的“经济实验教学中心建设与实践”荣获南开大学2006至2008年度教学实验室管理成果特等奖，中心承担的“经济实验教学综合改革项目”荣获南开大学2008年教学成果一等奖，中心承担的“经济学科实验教材研究创新与实践”荣获南开大学2006至2008年度实验教学技术成果一等奖。